Le choix d'un logiciel de facturation électronique pour une TPE dépend principalement de votre statut (micro-entreprise, SASU, EURL, TPE avec salariés), de la complexité de votre activité et de la façon dont vous travaillez avec votre expert-comptable.
Pour rappel, la réforme de la facturation électronique en France impose à toutes les entreprises de pouvoir recevoir des factures électroniques dès septembre 2026, et d'en émettre d'ici septembre 2027 pour les TPE/PME. Il est donc fortement recommandé d'opter dès maintenant pour un logiciel reconnu comme Plateforme Agréée (ex-PDP) ou connecté au réseau officiel.
Les principales solutions recommandées pour les TPE se distinguent par leur profil d'utilisation :
1. Pour les micro-entreprises, freelances et petites TPE (Simplicité & Petits budgets)
-
Tiime
- Points forts : Interface moderne, création rapide de devis/factures, synchronisation bancaire et gestion des notes de frais. Tiime fait partie des plateformes agréées par la DGFiP.
- Pour qui ? Les indépendants et TPE qui cherchent un outil simple, conforme et éventuellement couplé à un compte pro.
-
Indy
- Points forts : Très populaire pour les indépendants et TPE (EI, SASU, EURL). L'outil gère la facturation gratuitement, automatise la comptabilité et permet de télétransmettre les déclarations fiscales.
- Pour qui ? Ceux qui veulent centraliser la facturation et l'auto-gestion comptable au même endroit.
-
Henrri
- Points forts : Solution française 100 % gratuite sans limite de factures ni de clients. Très complet (relances automatiques, paiement en ligne, conformité légale).
- Pour qui ? Les très petites structures qui recherchent un outil purement orienté facturation/devis sans frais d'abonnement.
-
Abby
- Points forts : Dédié aux auto-entrepreneurs et micro-TPE. Prise en main rapide, suivi du chiffre d'affaires et déclaration URSSAF simplifiée.
2. Pour les TPE structurées (Besoin de CRM, gestion des stocks ou achats)
-
Axonaut
- Points forts : Véritable outil de gestion commerciale tout-en-un pour TPE (CRM, devis/factures, gestion de projets, trésorerie, stock, RH).
- Pour qui ? Les TPE ayant des commerciaux ou des besoins de suivi client et de gestion plus avancés.
-
Evoliz
- Points forts : Logiciel de gestion commerciale très intuitif, conçu spécifiquement pour les TPE/PME. Il s'intègre parfaitement avec les cabinets comptables et est prêt pour la facturation électronique au format Factur-X.
- Pour qui ? Les TPE recherchant un outil robuste pour gérer devis, factures, achats et trésorerie.
-
Sellsy
- Points forts : Suite logicielle complète (CRM, facturation, suivi des paiements, cash management).
- Pour qui ? Les TPE en forte croissance qui veulent piloter tout leur cycle de vente au même endroit.
3. Pour une collaboration fluide avec l'expert-comptable
- Pennylane
- Points forts : Plateforme financière et comptable complète. Elle permet à la TPE d'émettre ses factures, de gérer ses dépenses et de partager en temps réel toutes ses données avec son expert-comptable.
- Pour qui ? Les dirigeants qui veulent un pilotage financier précis et une comptabilité automatisée avec leur cabinet.
4. Si vous utilisez déjà un compte pro bancaire moderne
- Qonto ou Shine
- Si vous utilisez un compte professionnel en ligne comme Qonto ou Shine, sachez qu'ils intègrent désormais des modules complets de facturation électronique (création de devis/factures, relances, réconciliation bancaire automatique). Cela peut éviter de souscrire un logiciel tiers si vos besoins restent basiques.
Les critères à vérifier avant d'arrêter votre choix :
- Agrément / Conformité : Vérifiez que l'éditeur est prêt pour la réforme 2026/2027 (génération de factures structurées Factur-X, statut de Plateforme Agréée).
- Paiement en ligne : Possibilité d'intégrer un lien de paiement (Stripe, GoCardless, carte bancaire) directement sur la facture pour accélérer les encaissements.
- Export comptable : Capacité à exporter les écritures ou à donner un accès direct à votre expert-comptable.
- Volume et fonctionnalités : Vérifiez si le prix est fixe ou évolue selon votre chiffre d'affaires, le nombre de factures ou le nombre d'utilisateurs.